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Bio-Medizinische Bildverarbeitung

Ansprechpartner

Name
Forschungsbereich
Dr. Herbert Süße Segmentierung, Registrierung
Dr. Wolfgang Ortmann Segmentierung, Registrierung
Dipl.-Inf. Daniel Haase 
Detektion, Tracking
Dipl.-Inf. Manuel Amthor
Detektion, Tracking
Dipl.-Inf. Marco Körner
Detektion, Tracking, Segmentierung, Registrierung, Aktionserkennung
Xiaoyan Jiang, M.Sc.
Tracking
Mahesh Venkata Krishna, M.Sc.
Segmentierung, Aktionserkennung

Projekte


Avian Bipedal Locomotion

Ansprechpartner

Dipl.-Inf. Daniel Haase , Dipl.-Inf. Manuel Amthor

Zusammenfassung

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Segmentierung in Biomedizinischen Daten

Ansprechpartner

Dr. Herbert Süße, Dr. Wolfgang Ortmann, Dipl.-Inf. Marco Körner

Zusammenfassung

Da die durch moderne bildgebende Verfahren anfallenden Bilddaten meist nur langwierig durch Experten interpretiert werden können, bildet die automatische Segmentierung und Klassifikation von anatomischen oder pathologischen Bereichen einen besonders wichtigen Schwerpunkt der biomedizinisches Bildverarbeitung. Je nach konkreter Bildgebungsmethodik (Röntgen, MRT, CT, CLE, CLSM, ...) sieht man sich mit besonderen Stör- und Abbildungsprozessen konfrontiert, die klassische Bildverarbeitungsmethoden überfordern, weswegen hierfür jeweils spezielle Methoden entwickelt wurden.

Beispiel: Gefäßsegmentierung in CLE-Aufnahmen

odob_noise odob_result
Konfokale Laser-Endomikroskopie-Aufnahme (CLE) des Ileum eines Schweines; Pixel-Rauschen (A), Unschärfen (B) und ungewünschte Strukturen erschwären die Segmentierung der Blutgefäße innerhalb der Darmzotten.
Segmentierter hierarchischer Gefäßbaum als Ergebnis nicht-linearer Glättungsoperatoren entlang der Mikrostrukturen.

Beispiel: Segmentierung neuronaler Mitochondrien in CLSM-Aufnahmen

rgh_input rgh_result_lang rgh_result_silhouette
Konfokale-Laser-Scanning-Mikroskopie-Aufnahme (CLSM) einer Neuronenzelle mit fluoreszierend markierten Mitochondrienzellen. Segmentierte Mitochondrien während ihres Fusion-Fissions-Kreislaufs.
Durch Regularisierte Geometrische Hülle (RGH) approximierte Kontur der Neuronenzelle.


Detektion und Verfolgung

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Dipl.-Inf. Marco Körner, Dipl.-Inf. Daniel Haase, Xiaoyan Jiang, M.Sc.

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Registrierung

Ansprechpartner

Dr. Herbert Süße, Dr. Wolfgang Ortmann

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Publikationen